L'ultimo lavoro di Martin Scorsese dimostra la capacità di affrontare tematiche complesse con forza espressiva e padronanza stilistica.
Il film tratto dal romanzo di Shusaku Endo e ambientato nel XVII secolo narra della Compagnia di Gesù che decide di mandare in Giappone due giovani fratelli: Sebastian Rodrigues e Francisco Garupe per diffondere la fede e svolgere un'indagine sul padre gesuita Cristovao Ferreira, accusato di apostasia.
I due giovani Gesuiti, dotati di grande entusiasmo e spirito di sacrificio, dovranno presto confrontarsi con la dura realtà del Giappone e con le feroci repressioni. In questo periodo tanti cristiani, nonostante le atroci sofferenze, prima di morire invocano il nome di Cristo e levano l'ultimo inno alla sua gloria
Nel film c'è una grande comprensione per le debolezze umane riscattate dal perdono che eleva e irradia la persona.
Anche la fede viene messa a dura prova dal silenzio di Dio che sembra indifferente davanti alle sofferenze umane. Però è soltanto un silenzio apparente, poiché spetta all'uomo cogliere anche i più impercettibili segni.
Spesso Dio dà all'uomo la forza di superare le difficoltà, e cammina silenziosamente accanto a noi, partecipando alla nostra sofferenza, detergendola con le lacrime.
Il finale del film apre il cuore alla speranza, e mostra il gesuita morto con una croce di legno nelle mani, messa di nascosto dalla moglie . Ciò dimostra che il seme del cristianesimo, nonostante la feroce e violenta repressione, é riuscito a dare i suoi frutti.
Il film suona come un'intensa e commovente preghiera che si eleva verso le scintillanti e luminose sfere celesti.